More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2278 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  100 
 
 		 83 aa  170  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  84.42 
 
 		 81 aa  140  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  69.62 
 
 		 82 aa  122  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  61.25 
 
 		 81 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  56.25 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  55 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  57.69 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  54.32 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  54.32 
 
 		 89 aa  90.5  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 201 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0326  ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.679786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  50 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 87 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 83 aa  87.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 96 aa  86.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 81 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2187  30S ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0623355  normal  0.816199 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 192 aa  85.9  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0530  ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1374  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4175  30S ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  51.28 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5345  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  55.84 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 82 aa  84.3  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3136  ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0537506  normal  0.10713 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3355  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2703  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.457826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39161  Putative mitochondrial ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 102 aa  84  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 81 aa  83.6  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15970  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 83 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0228176  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  56.58 
 
 		 174 aa  83.6  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2919  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0919  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0403  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2545  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142898  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2968  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3401  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.587693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0569  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0228  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1661  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2859  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7465  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  53.25 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1512  ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819052  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  51.95 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2234  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.579388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  43.9 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1028  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  48.1 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2977  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0408161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0949  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4183  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1006  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  50.63 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0590  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0945  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1069  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345994  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  44.58 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1690  SSU ribosomal protein S16P  49.35 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1945  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2011  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2006  ribosomal protein S16  46.84 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000332773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  50 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1965  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>