More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1007 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 81 aa  167  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  84.42 
 
 		 83 aa  140  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  70.67 
 
 		 82 aa  117  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3355  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2703  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.457826  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0228  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 84 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0919  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 84 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0403  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 84 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2968  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 84 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1661  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 84 aa  91.3  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2545  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 84 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2919  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 84 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2859  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 84 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  59.21 
 
 		 81 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0769  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 84 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1028  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2977  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0408161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0949  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4183  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1690  SSU ribosomal protein S16P  55.84 
 
 		 83 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1006  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0590  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0945  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2234  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 84 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.579388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1069  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  56.58 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  56.58 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  58.11 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3136  ribosomal protein S16  58.11 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0537506  normal  0.10713 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  56.58 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3939  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 83 aa  87.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.505302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  52.44 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0933  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.054663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  58.11 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  56 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  54.05 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0326  ribosomal protein S16  59.46 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.679786 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  57.53 
 
 		 174 aa  86.3  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1473  ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  56.16 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0569  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  52.63 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1402  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 201 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1884  30S ribosomal protein S16  56 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5345  ribosomal protein S16  50 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  54.05 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1461  ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1512  ribosomal protein S16  54.79 
 
 		 156 aa  84.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819052  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0392  ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 84 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4008  ribosomal protein S16  55.41 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2187  30S ribosomal protein S16  56.76 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0623355  normal  0.816199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 85 aa  84.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  55.41 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 82 aa  84  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0979  30S ribosomal protein S16  55.41 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.924715  normal  0.291876 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  57.53 
 
 		 178 aa  83.6  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1617  ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 155 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0355567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1945  30S ribosomal protein S16  56.16 
 
 		 168 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2011  30S ribosomal protein S16  56.16 
 
 		 168 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  55.41 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1965  30S ribosomal protein S16  56.16 
 
 		 210 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  59.46 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1374  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  56.58 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  50 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4175  30S ribosomal protein S16  56.76 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  55.41 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 87 aa  83.6  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2334  SSU ribosomal protein S16P  47.56 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  59.46 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  53.42 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  54.79 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1285  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.362311  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0875  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0517  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  52.7 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  56 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  55.41 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  48.68 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  56 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>