More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2083 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  100 
 
 
156 aa  308  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1617  ribosomal protein S16  85.48 
 
 
155 aa  226  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0355567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1945  30S ribosomal protein S16  76.77 
 
 
168 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2011  30S ribosomal protein S16  76.77 
 
 
168 aa  221  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1965  30S ribosomal protein S16  76.77 
 
 
210 aa  219  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2187  30S ribosomal protein S16  80.83 
 
 
158 aa  207  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0623355  normal  0.816199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12923  30S ribosomal protein S16  78.69 
 
 
162 aa  206  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.826155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4175  30S ribosomal protein S16  80 
 
 
170 aa  205  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  77.59 
 
 
149 aa  186  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  80 
 
 
145 aa  184  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09750  SSU ribosomal protein S16P  80.65 
 
 
163 aa  178  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178453  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3136  ribosomal protein S16  72.22 
 
 
144 aa  177  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0537506  normal  0.10713 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  83.84 
 
 
141 aa  175  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  82.83 
 
 
142 aa  174  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  64.14 
 
 
178 aa  173  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4008  ribosomal protein S16  69.6 
 
 
145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3260  SSU ribosomal protein S16P  69.11 
 
 
465 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  82.47 
 
 
149 aa  170  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  79.59 
 
 
152 aa  170  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  77.78 
 
 
156 aa  167  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0979  30S ribosomal protein S16  69.29 
 
 
154 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.924715  normal  0.291876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1512  ribosomal protein S16  66.45 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819052  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  59.09 
 
 
168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  77.08 
 
 
157 aa  163  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  77.78 
 
 
136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  58.11 
 
 
146 aa  161  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  74.74 
 
 
136 aa  160  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  59.74 
 
 
153 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  65.08 
 
 
148 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  69.81 
 
 
159 aa  153  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  65.12 
 
 
174 aa  153  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  70.48 
 
 
131 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0326  ribosomal protein S16  69 
 
 
156 aa  152  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.679786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  66.07 
 
 
154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1148  30S ribosomal protein S16  62.9 
 
 
161 aa  150  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0271255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  71.11 
 
 
158 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  70 
 
 
154 aa  140  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1052  30S ribosomal protein S16  64 
 
 
153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  55.42 
 
 
90 aa  97.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  60.27 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  50.6 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 
81 aa  92.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  53.57 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  45.98 
 
 
88 aa  90.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  48.19 
 
 
139 aa  89  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  50 
 
 
84 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  51.16 
 
 
90 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  51.85 
 
 
93 aa  89  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  51.35 
 
 
81 aa  88.2  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 
81 aa  88.2  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  52.63 
 
 
93 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  55.13 
 
 
92 aa  87.8  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  51.16 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  50.59 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1501  ribosomal protein S16  50 
 
 
83 aa  87  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.019119  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  52 
 
 
81 aa  87  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  50.62 
 
 
201 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  50 
 
 
95 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  47.37 
 
 
191 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 
86 aa  86.3  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  56.16 
 
 
81 aa  86.3  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 
81 aa  85.5  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  52.56 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  54.76 
 
 
91 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  54.76 
 
 
91 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  45.24 
 
 
86 aa  84.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  44.58 
 
 
88 aa  84.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 
192 aa  84  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  44.58 
 
 
91 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  52.38 
 
 
91 aa  84  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  44.87 
 
 
81 aa  83.6  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  53.95 
 
 
83 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  51.28 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0810  30S ribosomal protein S16  55.07 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.753597  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  50.67 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1296  30S ribosomal protein S16  55.07 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0733  30S ribosomal protein S16  55.07 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140851  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 
134 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  50 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>