More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1296 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0810  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.753597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0733  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140851  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1296  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0996  30S ribosomal protein S16  90.67 
 
 
75 aa  142  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.631811  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1038  30S ribosomal protein S16  90.28 
 
 
75 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0520033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1433  ribosomal protein S16  84.72 
 
 
100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1649  ribosomal protein S16  79.73 
 
 
76 aa  124  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0676  ribosomal protein S16  86.57 
 
 
67 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0557  ribosomal protein S16  75.68 
 
 
75 aa  114  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.611754  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0451  30S ribosomal protein S16  71.62 
 
 
76 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0466  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 
86 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0442  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 
86 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 
90 aa  89  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  61.33 
 
 
95 aa  88.6  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3066  SSU ribosomal protein S16P  54.55 
 
 
84 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618527  hitchhiker  0.000000496657 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  61.33 
 
 
95 aa  88.6  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2540  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 
84 aa  87  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  58.33 
 
 
86 aa  87  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  56.52 
 
 
131 aa  86.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  54.67 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3016  SSU ribosomal protein S16P  51.35 
 
 
83 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00108733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  54.55 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  54.67 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  55.07 
 
 
174 aa  85.5  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  56 
 
 
87 aa  85.1  3e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  52 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  55.07 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  55.07 
 
 
159 aa  84  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  53.52 
 
 
148 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  58.33 
 
 
90 aa  83.6  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 
87 aa  83.2  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  56.16 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  52.17 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2781  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
83 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2234  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.579388  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  52.78 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0933  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.054663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0919  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  55.07 
 
 
156 aa  82  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0403  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2968  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  51.39 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2919  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2859  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7465  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1661  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3367  ribosomal protein S16  48.65 
 
 
82 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2334  SSU ribosomal protein S16P  48.05 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0228  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  56.94 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2545  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142898  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  52.78 
 
 
81 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1028  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4183  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1006  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0804  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0590  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0949  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2977  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0408161 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0769  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0945  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  52.11 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1069  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345994  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0875  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3203  30S ribosomal protein S16  47.3 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00186632  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  51.39 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01705  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.397905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1124  30S ribosomal protein S16  47.3 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  54.17 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  59.38 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  56.52 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  52 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  53.42 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  53.42 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  53.62 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  52.7 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0427  ribosomal protein S16  51.35 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  52.17 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0852  30S ribosomal protein S16  45.95 
 
 
82 aa  79.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000804578  hitchhiker  0.000061806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  52.7 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  53.03 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  58.46 
 
 
82 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  53.62 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  54.17 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3090  30S ribosomal protein S16  47.3 
 
 
82 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.248883  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  52.78 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  52.78 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 
83 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1402  ribosomal protein S16  49.35 
 
 
83 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  47.3 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2871  30S ribosomal protein S16  47.3 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.958206  normal  0.0386254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1884  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11426  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3364  30S ribosomal protein S16  47.22 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3228  30S ribosomal protein S16  47.22 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>