More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3594 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1148  30S ribosomal protein S16  90.24 
 
 		 161 aa  214  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0271255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0979  30S ribosomal protein S16  70.77 
 
 		 154 aa  183  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.924715  normal  0.291876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4008  ribosomal protein S16  66.94 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 168 aa  163  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  72.55 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  68.14 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1512  ribosomal protein S16  63.19 
 
 		 156 aa  159  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819052  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1945  30S ribosomal protein S16  63.11 
 
 		 168 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12923  30S ribosomal protein S16  63.93 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.826155 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2011  30S ribosomal protein S16  63.11 
 
 		 168 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  71.29 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  57.64 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1965  30S ribosomal protein S16  63.11 
 
 		 210 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3136  ribosomal protein S16  65.08 
 
 		 144 aa  157  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0537506  normal  0.10713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  67.26 
 
 		 156 aa  156  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1617  ribosomal protein S16  60.48 
 
 		 155 aa  153  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0355567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2187  30S ribosomal protein S16  62.93 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0623355  normal  0.816199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4175  30S ribosomal protein S16  63.79 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  69.31 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  57.64 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09750  SSU ribosomal protein S16P  63.71 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  63.73 
 
 		 145 aa  143  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  62.75 
 
 		 154 aa  141  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  70.45 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  71.59 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  70.45 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  67.05 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  50.34 
 
 		 178 aa  139  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  55.03 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  53.73 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3260  SSU ribosomal protein S16P  62.28 
 
 		 465 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  68.18 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  68.18 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  65.88 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0326  ribosomal protein S16  56.44 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.679786 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1052  30S ribosomal protein S16  50.88 
 
 		 153 aa  115  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  57.83 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  51.81 
 
 		 88 aa  95.9  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  51.19 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  48.81 
 
 		 88 aa  93.6  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 81 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  54.32 
 
 		 201 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 91 aa  92.8  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  48.84 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 93 aa  91.3  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  48.84 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  46.43 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 81 aa  90.1  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  49.33 
 
 		 81 aa  89.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 85 aa  88.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  45.88 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  53.42 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  53.85 
 
 		 85 aa  88.2  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 81 aa  87.8  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  52.7 
 
 		 82 aa  87  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0798  30S ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  52.7 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 192 aa  85.5  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  54.76 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  54.76 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  43.37 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1649  ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  50 
 
 		 191 aa  85.1  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  55.41 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 92 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 96 aa  84.3  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0733  30S ribosomal protein S16  53.52 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140851  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0810  30S ribosomal protein S16  53.52 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.753597  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  44.87 
 
 		 204 aa  84.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  52.7 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1296  30S ribosomal protein S16  53.52 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  43.37 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  43.59 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  41.18 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 82 aa  84  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1092  ribosomal protein S16  41.23 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000161695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  40 
 
 		 191 aa  83.6  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  46.67 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  49.41 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>