More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1649 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1649  ribosomal protein S16  100 
 
 
76 aa  155  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1038  30S ribosomal protein S16  81.08 
 
 
75 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0520033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0810  30S ribosomal protein S16  79.73 
 
 
75 aa  124  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.753597  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1296  30S ribosomal protein S16  79.73 
 
 
75 aa  124  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0733  30S ribosomal protein S16  79.73 
 
 
75 aa  124  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140851  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0996  30S ribosomal protein S16  75.68 
 
 
75 aa  120  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.631811  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1433  ribosomal protein S16  77.03 
 
 
100 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0557  ribosomal protein S16  75 
 
 
75 aa  114  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.611754  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0451  30S ribosomal protein S16  71.05 
 
 
76 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0676  ribosomal protein S16  74.63 
 
 
67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  58.97 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  57.69 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  58.57 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  55.13 
 
 
174 aa  88.2  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  53.85 
 
 
156 aa  87.8  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  60.29 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  52.56 
 
 
178 aa  88.2  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4008  ribosomal protein S16  56.16 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0466  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0442  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 
86 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  56.41 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  53.85 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  54.29 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  55.26 
 
 
201 aa  84.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  56.58 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 
148 aa  84.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  55.71 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  58.57 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 
81 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 
81 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  55.88 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  51.28 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 
86 aa  83.6  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  54.29 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  52.56 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  55.71 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  55.88 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  56.52 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  51.28 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3066  SSU ribosomal protein S16P  51.35 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618527  hitchhiker  0.000000496657 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  55.71 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1941  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  52.05 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1052  30S ribosomal protein S16  53.42 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  56.94 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 
87 aa  79.3  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1148  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0271255 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  46.05 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  52.11 
 
 
82 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  56.94 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3016  SSU ribosomal protein S16P  50.7 
 
 
83 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00108733  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0326  ribosomal protein S16  48.72 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.679786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  51.35 
 
 
109 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09750  SSU ribosomal protein S16P  48.72 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178453  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3367  ribosomal protein S16  49.3 
 
 
82 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  49.32 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  52.17 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  52.17 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0979  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.924715  normal  0.291876 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  51.28 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0846  ribosomal protein S16  50.7 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  48.68 
 
 
92 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2540  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2334  SSU ribosomal protein S16P  45.95 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  48.72 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2872  SSU ribosomal protein S16P  49.32 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  47.44 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  54.17 
 
 
81 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2048  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170111  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1916  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1963  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  49.28 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  50.68 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  50 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  55.88 
 
 
192 aa  77  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  49.28 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>