More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2872 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2872  SSU ribosomal protein S16P  100 
 
 		 84 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  44.32 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  54.17 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  52.17 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1649  ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0569  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  45.88 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  49.28 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  51.39 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2838  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2920  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  51.39 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  49.3 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  47.22 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1629  30S ribosomal protein S16  45.12 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000966466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0552  30S ribosomal protein S16  45.12 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.62972e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  42.67 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1357  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1052  30S ribosomal protein S16  45.21 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3017  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000030824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2260  ribosomal protein S16  46.25 
 
 		 80 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0142579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  48 
 
 		 185 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  45.83 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  44.74 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  47.22 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  40.7 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  47.22 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  46.58 
 
 		 86 aa  73.6  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  45.95 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  47.22 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  45.68 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  47.83 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 83 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2860  ribosomal protein S16  48.65 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2019  30S ribosomal protein S16  42.7 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.994387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  47.22 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  42.47 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  46.38 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0200  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198975  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0979  30S ribosomal protein S16  44.05 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.924715  normal  0.291876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1254  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000403035  hitchhiker  0.0000450288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  48.61 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  48.61 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2322  30S ribosomal protein S16  42.7 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  72  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1153  30S ribosomal protein S16  44.19 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01705  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.397905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1168  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  44.74 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1254  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000963986  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0073  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1287  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000457134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  42.35 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  44.74 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3103  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  normal  0.216318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1577  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 		 83 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.473483  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4069  ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00170773  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0451  30S ribosomal protein S16  47.14 
 
 		 76 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  42.86 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  48.61 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  47.83 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1501  ribosomal protein S16  45.07 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.019119  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0198  ribosomal protein S16  43.24 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  47.3 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  41.67 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  41.67 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  44.74 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0647  ribosomal protein S16  45.95 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1965  30S ribosomal protein S16  47.83 
 
 		 210 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1945  30S ribosomal protein S16  47.83 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  47.95 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2011  30S ribosomal protein S16  47.83 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0087  30S ribosomal protein S16  40.7 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  43.06 
 
 		 191 aa  70.1  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  51.56 
 
 		 186 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  41.67 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02147  30S ribosomal protein S16  40.48 
 
 		 85 aa  70.1  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918801  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  45.12 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0991  30S ribosomal protein S16  45.95 
 
 		 82 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0194612  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  43.42 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  43.02 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>