More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0451 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0451  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 76 aa  157  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1433  ribosomal protein S16  72.97 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1649  ribosomal protein S16  71.05 
 
 		 76 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1038  30S ribosomal protein S16  71.62 
 
 		 75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0520033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0810  30S ribosomal protein S16  71.62 
 
 		 75 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.753597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0733  30S ribosomal protein S16  71.62 
 
 		 75 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140851  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1296  30S ribosomal protein S16  71.62 
 
 		 75 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0996  30S ribosomal protein S16  70.27 
 
 		 75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.631811  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0557  ribosomal protein S16  65.79 
 
 		 75 aa  102  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.611754  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0676  ribosomal protein S16  67.16 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 90 aa  84.3  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  54.93 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  52.78 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  50 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  48.61 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0427  ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1185  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.426225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  44.74 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  54.17 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0466  30S ribosomal protein S16  51.39 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0442  30S ribosomal protein S16  51.39 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  52.17 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0798  30S ribosomal protein S16  53.42 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  55.07 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  55.07 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2781  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  54.41 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  54.41 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  49.28 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0073  30S ribosomal protein S16  49.3 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  47.95 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0087  30S ribosomal protein S16  49.3 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2260  ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0142579  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1052  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  46.58 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  49.32 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  46.58 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  50 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  47.95 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  47.95 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  50 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  50.7 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12923  30S ribosomal protein S16  46.58 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.826155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1462  30S ribosomal protein S16  49.3 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.065689  normal  0.177487 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 192 aa  72  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2977  30S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0408161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  52.11 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2280  30S ribosomal protein S16  49.3 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  50.7 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  46.15 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  50 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0949  30S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  47.44 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4183  30S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1067  30S ribosomal protein S16  49.3 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1006  30S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  47.95 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3367  ribosomal protein S16  48.61 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  42.47 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0590  30S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  46.84 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02147  30S ribosomal protein S16  49.3 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918801  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4157  30S ribosomal protein S16  49.3 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29802  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2234  30S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.579388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1028  30S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0945  30S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  52.11 
 
 		 81 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1069  30S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4259  30S ribosomal protein S16  49.3 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  50.72 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0769  30S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3203  30S ribosomal protein S16  47.89 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00186632  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  50.7 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2968  30S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 84 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>