More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1433 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1433  ribosomal protein S16  100 
 
 		 100 aa  204  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1038  30S ribosomal protein S16  86.67 
 
 		 75 aa  135  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0520033  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0996  30S ribosomal protein S16  84.72 
 
 		 75 aa  130  6.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.631811  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0733  30S ribosomal protein S16  84.72 
 
 		 75 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140851  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0810  30S ribosomal protein S16  84.72 
 
 		 75 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.753597  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1296  30S ribosomal protein S16  84.72 
 
 		 75 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0676  ribosomal protein S16  87.69 
 
 		 67 aa  123  9e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1649  ribosomal protein S16  77.03 
 
 		 76 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0451  30S ribosomal protein S16  72.97 
 
 		 76 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0557  ribosomal protein S16  75.68 
 
 		 75 aa  114  6e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.611754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  52 
 
 		 131 aa  84.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0466  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 86 aa  84.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0442  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 86 aa  84.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  50.67 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  50.67 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  54.79 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  50.67 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  50.67 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  52.11 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  50.67 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0427  ribosomal protein S16  52 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  52 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  52 
 
 		 201 aa  80.1  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3066  SSU ribosomal protein S16P  52 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618527  hitchhiker  0.000000496657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  51.43 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0846  ribosomal protein S16  50 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  43.42 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1941  30S ribosomal protein S16  48 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0180  ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1945  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  48 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  49.28 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2011  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3367  ribosomal protein S16  46.58 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  48 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1965  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  57.38 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  55.71 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  50.72 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  49.33 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  46.67 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  47.89 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2280  30S ribosomal protein S16  47.3 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111517  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1473  ribosomal protein S16  50 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.34731  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  51.43 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  52.86 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  50.67 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0919  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0403  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2968  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1661  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2545  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142898  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2334  SSU ribosomal protein S16P  46.67 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2859  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0228  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  46.67 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2919  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2234  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.579388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1282  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  48 
 
 		 136 aa  76.6  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  48 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2977  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0408161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1028  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  45.21 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0933  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.054663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  48 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2540  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4183  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1006  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2781  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0769  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12923  30S ribosomal protein S16  46.67 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.826155 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0590  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  56.52 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  56.52 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  48 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0945  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0875  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0804  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1069  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>