More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1038 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1038  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 75 aa  151  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0520033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0810  30S ribosomal protein S16  90.28 
 
 		 75 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.753597  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1296  30S ribosomal protein S16  90.28 
 
 		 75 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0733  30S ribosomal protein S16  90.28 
 
 		 75 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140851  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1433  ribosomal protein S16  86.67 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0996  30S ribosomal protein S16  88.89 
 
 		 75 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.631811  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1649  ribosomal protein S16  81.08 
 
 		 76 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0676  ribosomal protein S16  89.23 
 
 		 67 aa  123  9e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0557  ribosomal protein S16  81.08 
 
 		 75 aa  120  6e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.611754  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0451  30S ribosomal protein S16  71.62 
 
 		 76 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0466  30S ribosomal protein S16  55.41 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0442  30S ribosomal protein S16  55.41 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 87 aa  87  7e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  55.07 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3066  SSU ribosomal protein S16P  56.76 
 
 		 84 aa  86.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618527  hitchhiker  0.000000496657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2540  30S ribosomal protein S16  56.76 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  56.58 
 
 		 201 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  56.76 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2234  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.579388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2919  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0403  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2968  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0919  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1661  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2859  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2545  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142898  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0228  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0933  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.054663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4183  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  49.33 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0769  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0590  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0949  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0945  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1069  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3367  ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1028  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0804  30S ribosomal protein S16  52.7 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0875  30S ribosomal protein S16  52.7 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2977  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0408161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1006  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  59.09 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  59.09 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  49.33 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  49.33 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3016  SSU ribosomal protein S16P  48.65 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00108733  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  52.7 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  52.7 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0427  ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  52.17 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  50.7 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  46.67 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  52.11 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1285  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.362311  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1941  30S ribosomal protein S16  48 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1577  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.473483  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0517  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  51.47 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  54.29 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  48.57 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2781  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  54.41 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  55.71 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  55.71 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  48 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3203  30S ribosomal protein S16  46.58 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00186632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  49.33 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  52.11 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2334  SSU ribosomal protein S16P  47.3 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  48.57 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  49.33 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1124  30S ribosomal protein S16  46.58 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1148  30S ribosomal protein S16  46.67 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0271255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  45.33 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1473  ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  51.39 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  47.95 
 
 		 83 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  51.39 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  54.29 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0882  30S ribosomal protein S16  46.58 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3228  30S ribosomal protein S16  46.58 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3364  30S ribosomal protein S16  46.58 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0852  30S ribosomal protein S16  46.58 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000804578  hitchhiker  0.000061806 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 82 aa  76.6  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 90 aa  76.6  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>