More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0180 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0180  ribosomal protein S16  100 
 
 		 119 aa  240  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01705  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.397905  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  50.65 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 82 aa  84  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  49.35 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  48.1 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1577  30S ribosomal protein S16  48 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.473483  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  42.55 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1433  ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0915123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0979  30S ribosomal protein S16  43.27 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.924715  normal  0.291876 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  45.57 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3770  ribosomal protein S16  46.25 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000378706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0996  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.631811  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0095  30S ribosomal protein S16  48 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315992  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0798  30S ribosomal protein S16  48.1 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  43.52 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2860  ribosomal protein S16  39.74 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3004  30S ribosomal protein S16  42.31 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0878334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4069  ribosomal protein S16  42.67 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00170773  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2890  30S ribosomal protein S16  42.31 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0294051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2821  30S ribosomal protein S16  42.31 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2892  30S ribosomal protein S16  42.31 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  0.381108 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2871  30S ribosomal protein S16  42.31 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.958206  normal  0.0386254 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  45.12 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  38.95 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1185  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.426225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1124  30S ribosomal protein S16  39.74 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0649  30S ribosomal protein S16  45.33 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0268123  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  46.75 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3367  ribosomal protein S16  42.67 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  38.95 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  38.95 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1649  ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03480  30S ribosomal protein S16  46.67 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39161  Putative mitochondrial ribosomal protein S16  48.1 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02498  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0245657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1065  ribosomal protein S16  41.03 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000286149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1074  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0314963  normal  0.014008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2761  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377761  normal  0.0321443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2768  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000347369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2893  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000112425  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02462  hypothetical protein  41.03 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.014774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3848  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000663881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  42.86 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2998  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00134476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2280  30S ribosomal protein S16  44 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0882  30S ribosomal protein S16  38.46 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256318  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0810  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.753597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0073  30S ribosomal protein S16  44.16 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  44.44 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1296  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0733  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3364  30S ribosomal protein S16  38.46 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3228  30S ribosomal protein S16  38.46 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132458  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  45.33 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0991  30S ribosomal protein S16  41.03 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0194612  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  42.86 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3203  30S ribosomal protein S16  38.46 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00186632  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0852  30S ribosomal protein S16  39.74 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000804578  hitchhiker  0.000061806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  44 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19103  predicted protein  35.71 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  42.67 
 
 		 82 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  44 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3016  SSU ribosomal protein S16P  40.74 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00108733  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  37.08 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0087  30S ribosomal protein S16  44.16 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  42.86 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1038  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0520033  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  40 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1473  ribosomal protein S16  44.74 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.34731  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002536  SSU ribosomal protein S16p  45.33 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.01225  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4008  ribosomal protein S16  37.1 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  45.57 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 81 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  44 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3090  30S ribosomal protein S16  42.67 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.248883  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  42.86 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2838  30S ribosomal protein S16  43.59 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2920  30S ribosomal protein S16  43.59 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  44.16 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1282  30S ribosomal protein S16  44.59 
 
 		 85 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  37.78 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3099  ribosomal protein S16  41.03 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  45.57 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0451  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  42.67 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  40.66 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1357  30S ribosomal protein S16  42.31 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  45.45 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  42.67 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3017  30S ribosomal protein S16  42.31 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000030824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>