More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3099 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3099  ribosomal protein S16  100 
 
 
93 aa  189  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  54.67 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 
85 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  52 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  46.25 
 
 
81 aa  86.3  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1945  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  48 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  45 
 
 
80 aa  85.9  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12923  30S ribosomal protein S16  52 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.826155 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2011  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  49.33 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0979  30S ribosomal protein S16  46.07 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.924715  normal  0.291876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1965  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 
210 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  49.33 
 
 
149 aa  84.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  44.16 
 
 
154 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 
168 aa  84  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1617  ribosomal protein S16  48 
 
 
155 aa  84  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0355567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
87 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  48 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3136  ribosomal protein S16  48 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0537506  normal  0.10713 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  46.67 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1512  ribosomal protein S16  46.67 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819052  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  46.67 
 
 
156 aa  82  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  41.98 
 
 
81 aa  82  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  44.74 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  44.16 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  44.74 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  42.22 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  46.67 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  46.67 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  46.75 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  45.45 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  43.18 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  44.16 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  48 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  46.67 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2187  30S ribosomal protein S16  46.67 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0623355  normal  0.816199 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  46.67 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09750  SSU ribosomal protein S16P  45.33 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178453  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  48 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  45.95 
 
 
95 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  45.95 
 
 
95 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  42.86 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  45.33 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1148  30S ribosomal protein S16  48 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0271255 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  47.3 
 
 
93 aa  78.2  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  46.75 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  46.75 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4175  30S ribosomal protein S16  46.67 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  45.68 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  42.86 
 
 
81 aa  77  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4008  ribosomal protein S16  40.45 
 
 
145 aa  77  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  45.33 
 
 
85 aa  77  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  45.33 
 
 
82 aa  76.6  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  44.74 
 
 
81 aa  77  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  45.33 
 
 
82 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  41 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  46.75 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  47.3 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  42.11 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  40 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  40 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  44.59 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  45.33 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1153  30S ribosomal protein S16  42.35 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  43.75 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  44 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  41.56 
 
 
82 aa  75.5  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0180  ribosomal protein S16  38.04 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  44.59 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  44.16 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  45.33 
 
 
81 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  44 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  43.75 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  44.74 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  40.26 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  43.06 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  43.06 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  45 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  42.11 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  44.59 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  45 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  45 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  44.59 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  44.59 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  45 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>