More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0653 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 120 aa  234  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 120 aa  234  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  97 
 
 		 120 aa  198  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  95.88 
 
 		 120 aa  190  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  85.86 
 
 		 119 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  87.5 
 
 		 119 aa  176  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0069  30S ribosomal protein S16  71.84 
 
 		 120 aa  157  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0915038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  70.87 
 
 		 154 aa  157  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4075  30S ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 123 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1079  30S ribosomal protein S16  71.84 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0578935  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  63.06 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  69.9 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  65.05 
 
 		 201 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4205  30S ribosomal protein S16  63.64 
 
 		 123 aa  151  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.847506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  65.45 
 
 		 185 aa  150  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1824  30S ribosomal protein S16  67.96 
 
 		 134 aa  150  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1756  30S ribosomal protein S16  67.96 
 
 		 134 aa  150  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  73.2 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  67.96 
 
 		 134 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  65.79 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  70.83 
 
 		 120 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  64.08 
 
 		 121 aa  141  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 		 116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 		 116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  60.19 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  57.84 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  59.09 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  61.46 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  58.25 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3276  30S ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 113 aa  130  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  58.25 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  60.42 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1405  30S ribosomal protein S16  56.12 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.321443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0367  30S ribosomal protein S16  58.65 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0222  30S ribosomal protein S16  60.42 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932871  normal  0.0133225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  63.33 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3579  30S ribosomal protein S16  55.77 
 
 		 110 aa  124  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  57.73 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2780  30S ribosomal protein S16  56.73 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00569729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1185  30S ribosomal protein S16  55.77 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.426225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  53.92 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  60.98 
 
 		 139 aa  107  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0798  30S ribosomal protein S16  61.04 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0123  ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.622663  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  58.75 
 
 		 81 aa  101  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  57.65 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  49.46 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  58.54 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  55.17 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 81 aa  98.6  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 88 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 81 aa  94.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  46 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  52.87 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  48.24 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 81 aa  90.5  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  48.24 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 88 aa  90.1  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 87 aa  89.4  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  47.62 
 
 		 81 aa  90.1  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  51.19 
 
 		 81 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  45.88 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  45.88 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 81 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 81 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  48.24 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 197 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  45.88 
 
 		 82 aa  87.8  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 86 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  44.71 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  44.71 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  44.71 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 86 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  44.71 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  44.71 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>