More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1501 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1501  ribosomal protein S16  100 
 
 		 83 aa  166  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.019119  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  55.41 
 
 		 82 aa  94.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  58.11 
 
 		 82 aa  93.6  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 81 aa  92.8  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  52.56 
 
 		 81 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  51.95 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 81 aa  90.5  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  56.58 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 81 aa  88.6  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1945  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 168 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2011  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 168 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12923  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.826155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 81 aa  87.4  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  55.41 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  54.67 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1965  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 210 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  50 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  52 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  50.65 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  52.7 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3579  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  50 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  45.35 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0504  SSU ribosomal protein S16P  54.05 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2187  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0623355  normal  0.816199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0367  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  52.78 
 
 		 135 aa  84.3  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 116 aa  84.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2780  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00569729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 116 aa  84.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 91 aa  84.3  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0222  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932871  normal  0.0133225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1617  ribosomal protein S16  50 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0355567  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  45.78 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  50.63 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4175  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1357  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  50 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3017  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000030824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  45.33 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  45 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1168  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  47.95 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  46.75 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  46.75 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1254  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000403035  hitchhiker  0.0000450288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1254  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000963986  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2838  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2920  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1287  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000457134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  48.68 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3103  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  normal  0.216318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  51.32 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  49.35 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>