More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0504 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0504  SSU ribosomal protein S16P  100 
 
 		 83 aa  171  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  50 
 
 		 80 aa  90.9  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 86 aa  88.6  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 86 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 86 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  87.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  87.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1690  SSU ribosomal protein S16P  53.01 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2334  SSU ribosomal protein S16P  54.32 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2260  ribosomal protein S16  57.53 
 
 		 80 aa  87  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0142579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1254  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000403035  hitchhiker  0.0000450288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4157  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29802  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  51.32 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1462  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.065689  normal  0.177487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1067  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4259  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1501  ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.019119  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15970  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0228176  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1629  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 181 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000966466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 82 aa  83.6  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1374  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1168  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3401  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.587693 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0069  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0915038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  46.75 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0552  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.62972e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  50 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 83 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1254  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000963986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  51.32 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1287  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000457134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 83 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3103  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  normal  0.216318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2838  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2920  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4075  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  45.68 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4069  ribosomal protein S16  52.7 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00170773  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1357  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0846  ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3017  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000030824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2483  ribosomal protein S16  51.81 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.0960176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1461  ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  48.24 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  51.35 
 
 		 174 aa  80.5  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  45.68 
 
 		 81 aa  80.1  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  46.67 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2781  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2019  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.994387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  47.5 
 
 		 81 aa  80.1  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2322  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  44.74 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  46.75 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3276  30S ribosomal protein S16  46.75 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  46.75 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>