More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2483 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2483  ribosomal protein S16  100 
 
 		 86 aa  177  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.0960176 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 81 aa  87  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  54.79 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1690  SSU ribosomal protein S16P  52.56 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  54.79 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3355  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2703  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.457826  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1461  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 201 aa  83.6  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  47.06 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  47.13 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3939  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.505302 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3367  ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  44.32 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  44.32 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0875  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  53.42 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2540  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0804  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  53.42 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4069  ribosomal protein S16  50 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00170773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  48.68 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0504  SSU ribosomal protein S16P  51.81 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0392  ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0200  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198975  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0681  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2977  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0408161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1006  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  41.75 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0769  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0933  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.054663 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2019  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.994387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  50 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2322  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  43.68 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  45.88 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4183  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0647  ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0949  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  49.33 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  48.78 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0590  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1028  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0945  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1069  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2234  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.579388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2919  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1168  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2859  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2545  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142898  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0798  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0403  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2968  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1287  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000457134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1473  ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1104  30S ribosomal protein S16  52.38 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1254  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000963986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3103  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  normal  0.216318 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0919  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1661  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1405  30S ribosomal protein S16  43.02 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.321443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0228  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2838  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2920  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  45.98 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3066  SSU ribosomal protein S16P  46.99 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618527  hitchhiker  0.000000496657 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1916  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  44.74 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2334  SSU ribosomal protein S16P  51.32 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  0.0568349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>