More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2048 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1916  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 88 aa  177  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2048  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 88 aa  177  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170111  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1963  30S ribosomal protein S16  98.86 
 
 		 88 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1941  30S ribosomal protein S16  87.5 
 
 		 88 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  52 
 
 		 178 aa  90.5  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  46.91 
 
 		 81 aa  88.6  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  88.6  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1019  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247082  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1153  30S ribosomal protein S16  47.06 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 85 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 87 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0991  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 82 aa  87.4  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0194612  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3364  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 82 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1374  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 83 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0882  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 82 aa  86.7  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3228  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 82 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1254  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 83 aa  86.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000403035  hitchhiker  0.0000450288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2860  ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3203  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00186632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1577  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.473483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15970  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 83 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0228176  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2006  ribosomal protein S16  48.24 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000332773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1124  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  45.88 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  48.72 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2280  30S ribosomal protein S16  48 
 
 		 79 aa  84.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 83 aa  84.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  50.67 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 83 aa  84.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  46.59 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  46.59 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0466  30S ribosomal protein S16  45.88 
 
 		 86 aa  84  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0442  30S ribosomal protein S16  45.88 
 
 		 86 aa  84  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  45 
 
 		 80 aa  83.6  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4157  30S ribosomal protein S16  48 
 
 		 83 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29802  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0852  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 82 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000804578  hitchhiker  0.000061806 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2334  SSU ribosomal protein S16P  49.38 
 
 		 82 aa  83.6  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  46.34 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 93 aa  83.6  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1462  30S ribosomal protein S16  48 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.065689  normal  0.177487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4259  30S ribosomal protein S16  48 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1067  30S ribosomal protein S16  48 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  48.75 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1254  30S ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000963986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1473  ribosomal protein S16  45.24 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.34731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1287  30S ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000457134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1282  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1168  30S ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3103  30S ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  normal  0.216318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  43.59 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  44.74 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0681  30S ribosomal protein S16  45.88 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0933  30S ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.054663 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1629  30S ribosomal protein S16  45.24 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000966466  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0552  30S ribosomal protein S16  45.24 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.62972e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3367  ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2977  30S ribosomal protein S16  47.62 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0408161 
 
 
-
 
NC_004310  BR1824  30S ribosomal protein S16  45.35 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3770  ribosomal protein S16  44.44 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000378706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0069  30S ribosomal protein S16  45.35 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0915038  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1006  30S ribosomal protein S16  47.62 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3276  30S ribosomal protein S16  45.98 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1756  30S ribosomal protein S16  45.35 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  45.12 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  43.59 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  48 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  45.35 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  43.68 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  42.31 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  46.67 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4069  ribosomal protein S16  46.25 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00170773  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0804  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  48 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1028  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0949  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4183  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  43.59 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0326  ribosomal protein S16  45.33 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.679786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0846  ribosomal protein S16  47.3 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  43.68 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0590  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0945  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1069  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2968  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>