More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3260 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3260  SSU ribosomal protein S16P  100 
 
 		 465 aa  913    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1965  30S ribosomal protein S16  65.89 
 
 		 210 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  75 
 
 		 149 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1945  30S ribosomal protein S16  68.03 
 
 		 168 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2011  30S ribosomal protein S16  68.03 
 
 		 168 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  70.94 
 
 		 156 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  77.88 
 
 		 157 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1617  ribosomal protein S16  65.04 
 
 		 155 aa  163  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0355567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2187  30S ribosomal protein S16  68.38 
 
 		 158 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0623355  normal  0.816199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12923  30S ribosomal protein S16  65.29 
 
 		 162 aa  160  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.826155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4175  30S ribosomal protein S16  67.52 
 
 		 170 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  56.55 
 
 		 178 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1512  ribosomal protein S16  65.33 
 
 		 156 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819052  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  54.97 
 
 		 156 aa  152  8.999999999999999e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  77.66 
 
 		 136 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  72.28 
 
 		 141 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4008  ribosomal protein S16  60.98 
 
 		 145 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0979  30S ribosomal protein S16  63.08 
 
 		 154 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.924715  normal  0.291876 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  73.68 
 
 		 152 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  70.3 
 
 		 142 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  59.31 
 
 		 146 aa  147  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  56.29 
 
 		 159 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 145 aa  146  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  70.1 
 
 		 149 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  57.52 
 
 		 168 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09750  SSU ribosomal protein S16P  69.7 
 
 		 163 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 153 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  68.42 
 
 		 131 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  65.96 
 
 		 136 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  61.4 
 
 		 154 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1148  30S ribosomal protein S16  66.06 
 
 		 161 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0271255 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1052  30S ribosomal protein S16  65.98 
 
 		 153 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  63.55 
 
 		 148 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0326  ribosomal protein S16  64.95 
 
 		 156 aa  129  8.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.679786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3136  ribosomal protein S16  61.32 
 
 		 144 aa  129  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0537506  normal  0.10713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  58.4 
 
 		 174 aa  126  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  62.75 
 
 		 158 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  61.76 
 
 		 154 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  59.46 
 
 		 89 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 93 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 95 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  51.81 
 
 		 90 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  50 
 
 		 88 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 81 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  51.11 
 
 		 92 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 		 135 aa  83.2  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 		 81 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 192 aa  81.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  44.44 
 
 		 91 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  44.71 
 
 		 136 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  44.58 
 
 		 88 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  46.74 
 
 		 134 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 83 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0804  30S ribosomal protein S16  44.58 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  50.59 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 87 aa  79.7  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 		 88 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 		 88 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 88 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 96 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  45.24 
 
 		 86 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 82 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 186 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 81 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  47.3 
 
 		 81 aa  78.2  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  41.86 
 
 		 133 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  78.2  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  42.17 
 
 		 88 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  44.58 
 
 		 135 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  46.91 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 81 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  44.71 
 
 		 88 aa  77.4  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 87 aa  77.4  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1501  ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 83 aa  77.4  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.019119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  45.24 
 
 		 95 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  52.38 
 
 		 91 aa  77.4  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  52.38 
 
 		 91 aa  77.4  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 90 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  40.46 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 128 aa  76.3  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 81 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 81 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  54.79 
 
 		 81 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>