More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1028 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1028  ribosomal protein S16  100 
 
 
208 aa  390  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  52.25 
 
 
135 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  52.25 
 
 
135 aa  125  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  51.4 
 
 
134 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  51.61 
 
 
136 aa  116  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  42.76 
 
 
186 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  41.78 
 
 
192 aa  115  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  49.58 
 
 
197 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  50.54 
 
 
195 aa  112  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  51.61 
 
 
133 aa  112  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0804  30S ribosomal protein S16  48.39 
 
 
136 aa  109  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0117  30S ribosomal protein S16  39.66 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  56.98 
 
 
119 aa  108  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  48.24 
 
 
204 aa  108  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  47.42 
 
 
191 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
188 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  49.43 
 
 
146 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  52.08 
 
 
96 aa  101  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  47.78 
 
 
90 aa  101  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 
90 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 
90 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 
90 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 
90 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 
90 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 
90 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  45.88 
 
 
183 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 
90 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 
90 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 
90 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  48.89 
 
 
90 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  47.78 
 
 
90 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 
90 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  48.75 
 
 
139 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  51.19 
 
 
90 aa  99.8  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 
90 aa  99.4  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  53.57 
 
 
93 aa  99  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
88 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 
87 aa  98.2  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 
86 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 
81 aa  97.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 
81 aa  96.3  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  50 
 
 
88 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  51.25 
 
 
82 aa  94.7  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  45.24 
 
 
91 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 
81 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  51.25 
 
 
92 aa  93.2  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  48.72 
 
 
146 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 
86 aa  92.8  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 
88 aa  92.8  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  45 
 
 
88 aa  92.4  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 
90 aa  92.4  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  52.63 
 
 
81 aa  92.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  44.05 
 
 
96 aa  92.4  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  45.24 
 
 
91 aa  92  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  51.28 
 
 
149 aa  92  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  51.28 
 
 
131 aa  92  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  48.75 
 
 
82 aa  92  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  46.15 
 
 
154 aa  92  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  57.32 
 
 
91 aa  91.7  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 
168 aa  91.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  51.28 
 
 
157 aa  91.7  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  54.43 
 
 
82 aa  91.3  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 
154 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  45.24 
 
 
90 aa  90.9  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  51.28 
 
 
89 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  50 
 
 
95 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  50 
 
 
86 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  50 
 
 
86 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 
85 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  41.25 
 
 
90 aa  89.4  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  41.67 
 
 
88 aa  89.4  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3260  SSU ribosomal protein S16P  45.54 
 
 
465 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  46.15 
 
 
159 aa  89.4  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  47.44 
 
 
191 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 
174 aa  89  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  48.72 
 
 
141 aa  89  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  48.72 
 
 
142 aa  89  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09750  SSU ribosomal protein S16P  51.28 
 
 
163 aa  88.6  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178453  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  46.15 
 
 
156 aa  88.6  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  51.28 
 
 
93 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1512  ribosomal protein S16  47.44 
 
 
156 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819052  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1092  ribosomal protein S16  51.28 
 
 
119 aa  88.2  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000161695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  46.15 
 
 
178 aa  88.2  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  47.5 
 
 
89 aa  88.2  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  46.15 
 
 
152 aa  88.2  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1945  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 
168 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2011  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 
168 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  48.72 
 
 
149 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 
158 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 
91 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0979  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 
154 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.924715  normal  0.291876 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 
91 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
81 aa  86.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  46.43 
 
 
108 aa  86.7  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1965  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 
210 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  48.72 
 
 
156 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  47.44 
 
 
136 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 
81 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 
81 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 
88 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>