More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0123 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0123  ribosomal protein S16  100 
 
 		 85 aa  174  5e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.622663  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  66.23 
 
 		 201 aa  114  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  65.38 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  62.34 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1405  30S ribosomal protein S16  62.34 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.321443  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4205  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.847506  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4075  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 123 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  58.67 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  62.67 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  62.67 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  57.33 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  61.33 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  57.33 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_002978  WD0798  30S ribosomal protein S16  58.67 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  57.33 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1185  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.426225  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0069  30S ribosomal protein S16  59.74 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0915038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 130 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3276  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  56.58 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1079  30S ribosomal protein S16  60 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0578935  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1824  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1756  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  56 
 
 		 87 aa  93.6  9e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 87 aa  92  3e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0367  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0222  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932871  normal  0.0133225 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39161  Putative mitochondrial ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  51.95 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2780  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00569729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3579  30S ribosomal protein S16  49.32 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1287  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000457134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3103  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  normal  0.216318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1254  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000963986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1168  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19103  predicted protein  45.95 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  50.7 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2838  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2920  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  49.3 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2260  ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0142579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1019  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247082  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0530  ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1357  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0804  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1254  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000403035  hitchhiker  0.0000450288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15970  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0228176  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3017  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000030824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1462  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.065689  normal  0.177487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4259  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1374  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1067  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4157  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29802  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3401  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.587693 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  43.9 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  56.34 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  55.07 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  54.41 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3367  ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  49.32 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  47.95 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  53.62 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0846  ribosomal protein S16  46.75 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  44.3 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  47.3 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0392  ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4069  ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00170773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>