More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0665 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0665  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
101 aa  202  1e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.0000270999  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  54.32 
 
 
90 aa  94.7  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  54.32 
 
 
90 aa  94  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  49.44 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  47.78 
 
 
93 aa  87.8  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  46.15 
 
 
95 aa  86.3  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  47.06 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1447  ribosomal protein S16  47.83 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1863  ribosomal protein S16  49.43 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000617647  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  44.58 
 
 
139 aa  84.3  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  48.86 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  45.88 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  42.7 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 
95 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
90 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  43.82 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  46.15 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  40.43 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  40.43 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  45.57 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  46.34 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  45.68 
 
 
86 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  46.34 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  44.44 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  46.75 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  41.98 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  42.17 
 
 
88 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf245  ribosomal protein S16  42.86 
 
 
85 aa  77  0.00000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00213273  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  43.9 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  38.3 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  44.3 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  44.05 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  44.16 
 
 
82 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  42.86 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  42.31 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  39.08 
 
 
88 aa  72  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  37.65 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  48.1 
 
 
83 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  40.48 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  40.48 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  44.83 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  39.02 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  42.86 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  41.77 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  43.9 
 
 
120 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  42.17 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  44.16 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  42.86 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  42.17 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  41.77 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  40.26 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  45.45 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  37.04 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  44.16 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39161  Putative mitochondrial ribosomal protein S16  45 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  43.24 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  42.11 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  42.68 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  40.74 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  45.24 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  43.04 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  39.02 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  37.8 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  37.62 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  37.8 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  42.86 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  39.29 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  42.68 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5264  30S ribosomal protein S16  37.8 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  41.46 
 
 
121 aa  67  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  41.46 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2772  30S ribosomal protein S16  34.15 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.48934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  41.46 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  41.56 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  36.14 
 
 
88 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4357  30S ribosomal protein S16  35.37 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000000929169  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13321  30S ribosomal protein S16  32.29 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.257146  normal  0.676995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1185  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.426225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  42.86 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0073  30S ribosomal protein S16  41.56 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  38.46 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0087  30S ribosomal protein S16  41.56 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>