36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4362 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  92.27 
 
 
410 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  861    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  98.23 
 
 
452 aa  848    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  57.26 
 
 
402 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  25.82 
 
 
452 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  25.85 
 
 
451 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  33.19 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  26.98 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10683  hydrolase  32.18 
 
 
637 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000458391  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  31.25 
 
 
677 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3082  hypothetical protein  29.47 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  33.15 
 
 
643 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  25.85 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  27.42 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  31.12 
 
 
449 aa  70.1  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  26.73 
 
 
670 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20082  predicted protein  26.92 
 
 
716 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  27.89 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  25.74 
 
 
670 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  25.91 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  25.8 
 
 
461 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2570  Ceramidase  28.37 
 
 
610 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  30.6 
 
 
459 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  25.19 
 
 
462 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  26.18 
 
 
399 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  27.39 
 
 
494 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  23.59 
 
 
448 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  23.58 
 
 
455 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  24.75 
 
 
743 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  28.8 
 
 
461 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  21.19 
 
 
410 aa  51.6  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  23.51 
 
 
453 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  24.64 
 
 
682 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  27.32 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0119  hypothetical protein  32 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17634  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1095  hypothetical protein  26.33 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0776511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>