30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4675 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  95.37 
 
 		 670 aa  1311    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  100 
 
 		 670 aa  1393    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  41.46 
 
 		 682 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  43.4 
 
 		 643 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  39.16 
 
 		 743 aa  433  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10683  hydrolase  40.55 
 
 		 637 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000458391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20082  predicted protein  37.17 
 
 		 716 aa  373  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2570  Ceramidase  43.53 
 
 		 610 aa  335  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544363  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04245  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06470)  32.16 
 
 		 723 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  28.94 
 
 		 677 aa  137  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  26.74 
 
 		 402 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  24.41 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  27.31 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  28.51 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  26.92 
 
 		 398 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  26.73 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  26.17 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  26.73 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  28.05 
 
 		 452 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  27.94 
 
 		 410 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  26.8 
 
 		 449 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  24.12 
 
 		 494 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  25.91 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  23.81 
 
 		 448 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  25.42 
 
 		 399 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  25.53 
 
 		 459 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  26.83 
 
 		 451 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  20.37 
 
 		 410 aa  44.3  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  23.7 
 
 		 424 aa  43.9  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3082  hypothetical protein  30.37 
 
 		 430 aa  43.9  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>