36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4518 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  924    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  43.61 
 
 
452 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  36.2 
 
 
448 aa  269  8.999999999999999e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0597  hypothetical protein  34.44 
 
 
480 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  26.24 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  27.32 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  25.99 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  23.95 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  26.49 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  25.06 
 
 
449 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  23.32 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  26.49 
 
 
461 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  26.32 
 
 
461 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  25.09 
 
 
472 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  27.07 
 
 
494 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  28.18 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  26.37 
 
 
424 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  26.07 
 
 
453 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  27.12 
 
 
455 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  24.06 
 
 
677 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  29.82 
 
 
643 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  23.83 
 
 
398 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  25.3 
 
 
425 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  23.9 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  25 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  22.89 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  22.89 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  23.9 
 
 
423 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  26.83 
 
 
670 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1095  hypothetical protein  24.29 
 
 
415 aa  47  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0776511  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  26.28 
 
 
682 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  25.41 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  26.83 
 
 
670 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  22.62 
 
 
420 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  24.59 
 
 
417 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  23.77 
 
 
399 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>