41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4114 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  84.67 
 
 		 398 aa  674    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  795    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  32.3 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  29.58 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  31.4 
 
 		 461 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  31.6 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  27.09 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17634  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  22.9 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  26.9 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  31.12 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  29.97 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  30.73 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0293  hypothetical protein  25.93 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  29.11 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  26.23 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  26.47 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  25.88 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  26.04 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  22.83 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  21.98 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  23.02 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1095  hypothetical protein  25.21 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0776511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  24.77 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3398  hypothetical protein  25.82 
 
 		 550 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  27.36 
 
 		 643 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.72 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  26.5 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.72 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  22.74 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  23.08 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  26.69 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  21.72 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  25.42 
 
 		 670 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  24.32 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  24.58 
 
 		 670 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  25.85 
 
 		 677 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.75 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  27.19 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  23.77 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10683  hydrolase  24.76 
 
 		 637 aa  42.7  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000458391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>