39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0355 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  954    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  61.63 
 
 
453 aa  562  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  59.53 
 
 
455 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3398  hypothetical protein  26.7 
 
 
550 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634058  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  26.33 
 
 
436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  26.64 
 
 
472 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  27.96 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  25.47 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  23.6 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  25.77 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  23.7 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  23.47 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  26.09 
 
 
462 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  23.23 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  22.87 
 
 
420 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  22.87 
 
 
423 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  22.87 
 
 
420 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0119  hypothetical protein  25.78 
 
 
461 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17634  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  23.53 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  24.37 
 
 
494 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  27.46 
 
 
398 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  30.57 
 
 
399 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  23.35 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  22.67 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  24.45 
 
 
670 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  24.72 
 
 
670 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  25 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  23.69 
 
 
452 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  21.02 
 
 
433 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  32.29 
 
 
677 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  23.56 
 
 
461 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  25.45 
 
 
452 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  25.38 
 
 
452 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  25.71 
 
 
448 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  25.19 
 
 
410 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  23.38 
 
 
682 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0824  alkaline ceramidase domain protein  24.31 
 
 
268 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  26.16 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0353  signal peptide  22.39 
 
 
463 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00190338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>