40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0966 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  918    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  57.81 
 
 
494 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0293  hypothetical protein  32.64 
 
 
351 aa  111  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  32.1 
 
 
472 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  27.96 
 
 
462 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  29.55 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  29.53 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  24.58 
 
 
461 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  23 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  25.23 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  25.61 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  28.4 
 
 
459 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  25.06 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  27.83 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  29.88 
 
 
452 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  28.81 
 
 
398 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  29.88 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  23.68 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  23.68 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  26.1 
 
 
436 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  25 
 
 
462 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  24.44 
 
 
448 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  23.44 
 
 
423 aa  57  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  31.12 
 
 
410 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  29.72 
 
 
424 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  25.86 
 
 
425 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  26.69 
 
 
670 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  26.5 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  26.41 
 
 
423 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  24.24 
 
 
743 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  25.7 
 
 
670 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  25.21 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  25.29 
 
 
677 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0119  hypothetical protein  28.34 
 
 
461 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17634  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  24.88 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  24.46 
 
 
420 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  22.68 
 
 
415 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20082  predicted protein  25.32 
 
 
716 aa  46.6  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3398  hypothetical protein  21.74 
 
 
550 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634058  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0597  hypothetical protein  36.26 
 
 
480 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>