35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4410 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  931    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  43.61 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  36.74 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0597  hypothetical protein  25.71 
 
 		 480 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  26.09 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  25.9 
 
 		 452 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  25.45 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  27.41 
 
 		 436 aa  86.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  24.58 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  23 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  26.09 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  25.18 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  23.82 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  26.23 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  27.85 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  20.41 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  24.62 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  26.8 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  24.5 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  23.69 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  27.86 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  28.05 
 
 		 670 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  25 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  26.51 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  27.6 
 
 		 670 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  24.15 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  24.15 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  22.91 
 
 		 420 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  22.91 
 
 		 420 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  23.77 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  23.98 
 
 		 459 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1095  hypothetical protein  21.45 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0776511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  24.19 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  24.7 
 
 		 677 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0293  hypothetical protein  20.92 
 
 		 351 aa  43.1  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>