39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4581 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  1013    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  57.81 
 
 
449 aa  525  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  29.22 
 
 
472 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  26.2 
 
 
461 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0293  hypothetical protein  29.71 
 
 
351 aa  94.7  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  22.96 
 
 
461 aa  89.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  28.74 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  30.04 
 
 
455 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  26.09 
 
 
452 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  24.37 
 
 
462 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  30.43 
 
 
433 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  27.04 
 
 
425 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  26.83 
 
 
459 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  27.07 
 
 
451 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  24.24 
 
 
677 aa  63.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  25.93 
 
 
423 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  27.04 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  27.04 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  27.04 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  27.05 
 
 
420 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  23.36 
 
 
427 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  24.2 
 
 
448 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  26.18 
 
 
423 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20082  predicted protein  26.58 
 
 
716 aa  57  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  23.13 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  26.56 
 
 
452 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  25.24 
 
 
417 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  26.56 
 
 
452 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  24.06 
 
 
402 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  25.2 
 
 
436 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  25.09 
 
 
670 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  24.07 
 
 
415 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  24.73 
 
 
670 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3398  hypothetical protein  23.33 
 
 
550 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634058  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  23.86 
 
 
424 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  26.42 
 
 
410 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  27.27 
 
 
398 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3082  hypothetical protein  36.62 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0353  signal peptide  22.29 
 
 
463 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00190338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>