47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3850 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  953    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  31.47 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  29.06 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  29.93 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0119  hypothetical protein  34.59 
 
 		 461 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17634  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  26.47 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  25.11 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  26.06 
 
 		 420 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  26.06 
 
 		 420 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  25.78 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  26.17 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  24.95 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  25.91 
 
 		 415 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  24.22 
 
 		 423 aa  113  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  26.49 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  28.76 
 
 		 455 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  29.22 
 
 		 494 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  32.1 
 
 		 449 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  27.09 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  26.85 
 
 		 436 aa  93.2  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  32.37 
 
 		 398 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3398  hypothetical protein  20.94 
 
 		 550 aa  87.4  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  27.76 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  32.94 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  31.6 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0824  alkaline ceramidase domain protein  24.56 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  31.4 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  28.18 
 
 		 677 aa  76.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  31.28 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  29.48 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  25.05 
 
 		 670 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  22.74 
 
 		 424 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  25.09 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  24.7 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  24.47 
 
 		 670 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  20.41 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  32.69 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0293  hypothetical protein  22.03 
 
 		 351 aa  56.2  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  21.92 
 
 		 743 aa  53.5  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3082  hypothetical protein  26.28 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  23.79 
 
 		 643 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1095  hypothetical protein  27.51 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0776511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  23.66 
 
 		 448 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0823  alkaline ceramidase domain protein  28.57 
 
 		 125 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0669  ATP-dependent helicase HrpB  26.06 
 
 		 841 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  20 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2570  Ceramidase  23.55 
 
 		 610 aa  43.5  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>