22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0673 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  100 
 
 
643 aa  1303    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10683  hydrolase  49.7 
 
 
637 aa  553  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000458391  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  42.54 
 
 
682 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  43.4 
 
 
670 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  43.08 
 
 
670 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2570  Ceramidase  44.46 
 
 
610 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544363  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  32.42 
 
 
743 aa  282  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20082  predicted protein  32.29 
 
 
716 aa  274  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04245  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06470)  28.32 
 
 
723 aa  207  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162608  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  31.25 
 
 
677 aa  142  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  31.06 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  33.15 
 
 
452 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  33.15 
 
 
452 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  33.7 
 
 
410 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  29.82 
 
 
451 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  27.36 
 
 
399 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  23.79 
 
 
472 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  26.47 
 
 
398 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3082  hypothetical protein  31.4 
 
 
430 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0597  hypothetical protein  27.88 
 
 
480 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  24.23 
 
 
433 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  21.76 
 
 
453 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>