40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2360 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  100 
 
 
677 aa  1394    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  31.25 
 
 
643 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  28.94 
 
 
670 aa  137  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  28.35 
 
 
670 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2570  Ceramidase  27.25 
 
 
610 aa  126  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544363  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10683  hydrolase  28.4 
 
 
637 aa  123  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000458391  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  26.69 
 
 
743 aa  114  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  26.14 
 
 
682 aa  96.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20082  predicted protein  28.46 
 
 
716 aa  79.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  28.18 
 
 
472 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.167663 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04245  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06470)  23.91 
 
 
723 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162608  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  31.11 
 
 
452 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  32 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  24.24 
 
 
494 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  31.11 
 
 
410 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  24.73 
 
 
453 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  26.03 
 
 
433 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  27.86 
 
 
459 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  25.69 
 
 
402 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3082  hypothetical protein  26.6 
 
 
430 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  24.09 
 
 
424 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1095  hypothetical protein  25.95 
 
 
415 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0776511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  32.29 
 
 
462 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  28.39 
 
 
461 aa  55.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  19.8 
 
 
420 aa  54.7  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  24.06 
 
 
451 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  25.58 
 
 
455 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  28.4 
 
 
398 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  20.81 
 
 
420 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  20.81 
 
 
420 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  20.6 
 
 
423 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  25.3 
 
 
461 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  25.29 
 
 
449 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  19.68 
 
 
410 aa  48.9  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  20.04 
 
 
423 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  21.44 
 
 
425 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  25.85 
 
 
399 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  21.02 
 
 
417 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  32.32 
 
 
427 aa  45.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  24.7 
 
 
452 aa  44.3  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>