17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2292 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  100 
 
 
743 aa  1540    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  39.16 
 
 
670 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  39.35 
 
 
670 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10683  hydrolase  33.78 
 
 
637 aa  325  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000458391  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  33.04 
 
 
682 aa  320  6e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20082  predicted protein  31.91 
 
 
716 aa  291  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  32.42 
 
 
643 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2570  Ceramidase  32.33 
 
 
610 aa  266  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544363  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04245  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06470)  29.06 
 
 
723 aa  238  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162608  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  26.69 
 
 
677 aa  114  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  24.88 
 
 
402 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  27.78 
 
 
433 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  24.24 
 
 
449 aa  50.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  25.53 
 
 
448 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  22.69 
 
 
410 aa  47  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  24.63 
 
 
452 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  25.38 
 
 
462 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>