17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2003 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  100 
 
 		 682 aa  1391    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  41.46 
 
 		 670 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  41.1 
 
 		 670 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10683  hydrolase  41.81 
 
 		 637 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000458391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  42.54 
 
 		 643 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2570  Ceramidase  39.19 
 
 		 610 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544363  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  33.48 
 
 		 743 aa  326  7e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20082  predicted protein  33.33 
 
 		 716 aa  286  7e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04245  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06470)  30.38 
 
 		 723 aa  283  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  26.1 
 
 		 677 aa  99.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  26.18 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  28.22 
 
 		 402 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  25.76 
 
 		 453 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  23.38 
 
 		 462 aa  50.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  24.64 
 
 		 452 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  26.28 
 
 		 451 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  24.64 
 
 		 452 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>