16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2570 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2570  Ceramidase  100 
 
 
610 aa  1227    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  44.46 
 
 
643 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10683  hydrolase  40.64 
 
 
637 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000458391  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  39.03 
 
 
682 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  43.53 
 
 
670 aa  336  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  37.54 
 
 
670 aa  326  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  32.33 
 
 
743 aa  266  8.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20082  predicted protein  32.1 
 
 
716 aa  240  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04245  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06470)  31.75 
 
 
723 aa  200  7.999999999999999e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162608  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  27.25 
 
 
677 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  27.41 
 
 
455 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  33.33 
 
 
402 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  27.88 
 
 
452 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  28.85 
 
 
410 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  27.4 
 
 
452 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  28.19 
 
 
453 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>