28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53340 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  100 
 
 		 670 aa  1391    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  95.37 
 
 		 670 aa  1314    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  41 
 
 		 682 aa  449  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  39.35 
 
 		 743 aa  431  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10683  hydrolase  40.99 
 
 		 637 aa  429  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000458391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  43.08 
 
 		 643 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20082  predicted protein  36.41 
 
 		 716 aa  356  6.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2570  Ceramidase  37.54 
 
 		 610 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544363  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04245  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06470)  32.91 
 
 		 723 aa  288  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  27.78 
 
 		 677 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  27.13 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  24.41 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  28.1 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  26.51 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  26.07 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  26.38 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  25.74 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  25.74 
 
 		 452 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  27.6 
 
 		 452 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  25.55 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  24.26 
 
 		 494 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  26.21 
 
 		 449 aa  53.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  26.96 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  24.58 
 
 		 399 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  25.79 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  26.83 
 
 		 451 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  24.11 
 
 		 459 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  22.01 
 
 		 423 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>