35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5254 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  949    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0119  hypothetical protein  47.6 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17634  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  44.2 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  28.21 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  23.27 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  23.74 
 
 		 420 aa  93.2  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  24.19 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  24.08 
 
 		 420 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  24.08 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  24.08 
 
 		 420 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  24.83 
 
 		 455 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  23.19 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  23.38 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  25.4 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  27.35 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  23.57 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  26.09 
 
 		 462 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  30.58 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0824  alkaline ceramidase domain protein  24.79 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  30.91 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  27.89 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  25 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  27.89 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  28.95 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3398  hypothetical protein  19.23 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  30.06 
 
 		 398 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  34.11 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  25.91 
 
 		 670 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0293  hypothetical protein  23.42 
 
 		 351 aa  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3082  hypothetical protein  29.38 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  26.98 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  25.56 
 
 		 461 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  25.7 
 
 		 461 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  25.79 
 
 		 670 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  25.38 
 
 		 743 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>