34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3339 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  862    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  26.3 
 
 
455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  28.04 
 
 
453 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  26.33 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  30.77 
 
 
472 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3398  hypothetical protein  23.23 
 
 
550 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634058  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  27.41 
 
 
452 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  27.35 
 
 
462 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.84 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  22.25 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  30.52 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  31.12 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  22.68 
 
 
425 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  22.62 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  21.28 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  21.26 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  20.97 
 
 
410 aa  69.7  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  26.49 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.95 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.95 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  29.05 
 
 
398 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  23.24 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  26.02 
 
 
459 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  22.34 
 
 
417 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  22.64 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  23.9 
 
 
433 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  26.1 
 
 
449 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0824  alkaline ceramidase domain protein  23.72 
 
 
268 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  22.35 
 
 
461 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  25.2 
 
 
494 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0353  signal peptide  21.03 
 
 
463 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00190338  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3082  hypothetical protein  25.6 
 
 
430 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0119  hypothetical protein  29.32 
 
 
461 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17634  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  26.59 
 
 
452 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>