32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1887 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  100 
 
 		 461 aa  952    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  25.5 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  26.2 
 
 		 494 aa  99.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  23.64 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  23.64 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  23.64 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  22.89 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  22.71 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  23.15 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  24.58 
 
 		 449 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  22.65 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  22.71 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  23.06 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  22.59 
 
 		 417 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  26.49 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  24.11 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  21.86 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  27.86 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  23.49 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  27.31 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  26.2 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  23.56 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  25.8 
 
 		 452 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0824  alkaline ceramidase domain protein  43.33 
 
 		 268 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  22.17 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  22.35 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  25.3 
 
 		 677 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  26.19 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  25.56 
 
 		 462 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  21.69 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3398  hypothetical protein  22.75 
 
 		 550 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0293  hypothetical protein  25.19 
 
 		 351 aa  43.5  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>