43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0602 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  929    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  59.82 
 
 
455 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  61.63 
 
 
462 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  29.49 
 
 
472 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3398  hypothetical protein  26.65 
 
 
550 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634058  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  28.04 
 
 
436 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  25 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  24.94 
 
 
427 aa  89.7  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  25.37 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  25.35 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  24.66 
 
 
423 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  24.88 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  24.43 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  25 
 
 
459 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  23.93 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  25 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  25 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  24.68 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  25.4 
 
 
462 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  29.55 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  27.04 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  28.74 
 
 
494 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  26.6 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  27.09 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0119  hypothetical protein  24.27 
 
 
461 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17634  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0824  alkaline ceramidase domain protein  26.14 
 
 
268 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  28.29 
 
 
448 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  28.51 
 
 
670 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  24.73 
 
 
677 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  28.1 
 
 
670 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  23.49 
 
 
461 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  25.06 
 
 
433 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  24.11 
 
 
461 aa  56.6  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  25 
 
 
452 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0353  signal peptide  23.15 
 
 
463 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00190338  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  26.07 
 
 
451 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  25.76 
 
 
682 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  25.45 
 
 
410 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2570  Ceramidase  28.19 
 
 
610 aa  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544363  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  23.77 
 
 
452 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  23.51 
 
 
452 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  21.76 
 
 
643 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  26.94 
 
 
402 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>