34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3456 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  932    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  36.2 
 
 
451 aa  279  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  36.92 
 
 
452 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0597  hypothetical protein  23.27 
 
 
480 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  24.74 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  22.88 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  27.54 
 
 
455 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  28.29 
 
 
453 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  25.67 
 
 
424 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  24.23 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  26.39 
 
 
494 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  24.44 
 
 
449 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  22.22 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  28.14 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.96 
 
 
423 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  25.54 
 
 
461 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  25.55 
 
 
670 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  21.35 
 
 
415 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  23.45 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  25.71 
 
 
462 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  21.73 
 
 
423 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.73 
 
 
420 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.73 
 
 
420 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  23.81 
 
 
670 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  22.76 
 
 
452 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  22.79 
 
 
452 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  23.66 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  23.3 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  25.53 
 
 
743 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  21.78 
 
 
423 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  26.75 
 
 
398 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  23.85 
 
 
425 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20082  predicted protein  23.9 
 
 
716 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  27.19 
 
 
399 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>