17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20082 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_20082  predicted protein  100 
 
 
716 aa  1490    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04245  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06470)  36.19 
 
 
723 aa  382  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162608  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  37.02 
 
 
670 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  36.41 
 
 
670 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.19927 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  31.91 
 
 
743 aa  291  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10683  hydrolase  31.05 
 
 
637 aa  287  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000458391  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  33.33 
 
 
682 aa  277  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  32.29 
 
 
643 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2570  Ceramidase  32.1 
 
 
610 aa  240  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544363  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  28.46 
 
 
677 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  26.92 
 
 
402 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  26.82 
 
 
410 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  25 
 
 
452 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  26.58 
 
 
494 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  25.29 
 
 
452 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  23.9 
 
 
448 aa  47.4  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  25.32 
 
 
449 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>