38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3218 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  875    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  69.81 
 
 		 433 aa  628  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  29.58 
 
 		 399 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  29.95 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  25.2 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  25.78 
 
 		 453 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  22.53 
 
 		 472 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  26.97 
 
 		 461 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  26.62 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  25.67 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  25 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  26.18 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1095  hypothetical protein  22.89 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0776511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  28.42 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  26.8 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  30.91 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  22.64 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  29.29 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  24.09 
 
 		 677 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  28.3 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0119  hypothetical protein  27.42 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17634  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  25.84 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  21.54 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.39 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  25.08 
 
 		 410 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0353  signal peptide  23.88 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00190338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  25.08 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  21.31 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  23.86 
 
 		 494 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3398  hypothetical protein  21.83 
 
 		 550 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634058  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  20.33 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  21.69 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  20.33 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  20.33 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  20.61 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  20.56 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  23.99 
 
 		 670 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  23.25 
 
 		 670 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.19927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>