26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3398 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3398  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1142    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634058  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  26.7 
 
 
462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  26.65 
 
 
453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  24.8 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  23.23 
 
 
436 aa  92.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  20.88 
 
 
472 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  23.62 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  25.2 
 
 
417 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  25.2 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  25.89 
 
 
461 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  24.43 
 
 
423 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  24.18 
 
 
420 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  23.98 
 
 
420 aa  64.7  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  23.98 
 
 
420 aa  64.7  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  24.74 
 
 
423 aa  64.3  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  24.62 
 
 
415 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  23.32 
 
 
459 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  23.66 
 
 
423 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  19.33 
 
 
462 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  23.58 
 
 
433 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  25.82 
 
 
399 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  23.33 
 
 
494 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  21.83 
 
 
424 aa  50.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0824  alkaline ceramidase domain protein  22.27 
 
 
268 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  23.19 
 
 
461 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  21.74 
 
 
449 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>