40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3853 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  933    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  44.2 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0119  hypothetical protein  46.1 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17634  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  31.84 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  22.65 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  22.4 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  22.15 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.83 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.83 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  22 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  22.22 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  21.83 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  26.01 
 
 		 455 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  21.09 
 
 		 417 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  25 
 
 		 453 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  26.79 
 
 		 462 aa  86.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  24.73 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  23.63 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  23.72 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  29.76 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  26.76 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0293  hypothetical protein  27.95 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  30.73 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3398  hypothetical protein  23.59 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1887  signal peptide  22.05 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0824  alkaline ceramidase domain protein  19.76 
 
 		 268 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  26.02 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  28.42 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  32.42 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  29.08 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  28.37 
 
 		 677 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  30.18 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3082  hypothetical protein  27.07 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  30 
 
 		 452 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  30.18 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  21.76 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  20.04 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10683  hydrolase  24.5 
 
 		 637 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000458391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  25.53 
 
 		 670 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53340  hypothetical protein  24.11 
 
 		 670 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.19927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>