39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6613 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  885    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  71.92 
 
 
424 aa  626  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4114  hypothetical protein  31.23 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1384  hypothetical protein  31.88 
 
 
398 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  27.76 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3456  hypothetical protein  24.74 
 
 
448 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0337071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  25.23 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  26.98 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  30.58 
 
 
462 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  26.76 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0119  hypothetical protein  28.85 
 
 
461 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17634  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  25.95 
 
 
459 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  26.82 
 
 
461 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  20.66 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  31.22 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  30.63 
 
 
494 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4518  hypothetical protein  28.18 
 
 
451 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4410  hypothetical protein  27.85 
 
 
452 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  26.14 
 
 
410 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  26.03 
 
 
677 aa  59.7  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1095  hypothetical protein  22.51 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0776511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  23.9 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0602  hypothetical protein  25.06 
 
 
453 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0355  hypothetical protein  21.02 
 
 
462 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000192984  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  26.34 
 
 
455 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  22.25 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3398  hypothetical protein  23.58 
 
 
550 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634058  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.86 
 
 
423 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  21.23 
 
 
423 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2292  neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  27.78 
 
 
743 aa  53.1  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401419 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.23 
 
 
420 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.23 
 
 
420 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  22.09 
 
 
427 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  21.05 
 
 
425 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  20.88 
 
 
415 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  24.77 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  21.64 
 
 
417 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3082  hypothetical protein  26.74 
 
 
430 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  24.23 
 
 
643 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>