32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3082 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3082  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  830    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4362  hypothetical protein  29.47 
 
 
452 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4339  hypothetical protein  29.22 
 
 
452 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4207  hypothetical protein  28.89 
 
 
410 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1095  hypothetical protein  27.75 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0776511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2360  hypothetical protein  26.6 
 
 
677 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0223287  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0295  hypothetical protein  20.79 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4444  hypothetical protein  31.58 
 
 
461 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344312  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0681  alkaline ceramidase domain-containing protein  23.54 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0859  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.34 
 
 
423 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0732  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.29 
 
 
420 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0768  alkaline ceramidase domain-containing protein  21.29 
 
 
420 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0681  hypothetical protein  21.05 
 
 
423 aa  57.4  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5254  hypothetical protein  25.73 
 
 
462 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724384  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0865  alkaline ceramidase domain protein  21.08 
 
 
415 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000552997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0824  alkaline ceramidase domain protein  22.96 
 
 
268 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1053  hypothetical protein  40.3 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0062163  hitchhiker  0.0000000635319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3853  hypothetical protein  26.83 
 
 
459 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.676835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3339  hypothetical protein  26.95 
 
 
436 aa  53.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3850  hypothetical protein  25.16 
 
 
472 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0669  hypothetical protein  20.57 
 
 
425 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0934  alkaline ceramidase domain protein  21.15 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4511  alkaline ceramidase domain protein  21.62 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3218  hypothetical protein  21.53 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6613  hypothetical protein  25.29 
 
 
433 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0673  Neutral/alkaline nonlysosomal ceramidase  31.4 
 
 
643 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4491  hypothetical protein  22.65 
 
 
455 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4581  hypothetical protein  36.62 
 
 
494 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4355  hypothetical protein  31.12 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4675  hypothetical protein  30.37 
 
 
670 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2003  Ceramidase  29.91 
 
 
682 aa  43.9  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.921318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0966  hypothetical protein  24.49 
 
 
449 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>