More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0357 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  768    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  94.16 
 
 
394 aa  700    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  47.56 
 
 
418 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  46.33 
 
 
412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  43.08 
 
 
411 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  38.9 
 
 
413 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  40.4 
 
 
425 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  36.9 
 
 
436 aa  226  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  36.34 
 
 
455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  34.58 
 
 
439 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  34.09 
 
 
475 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  33.15 
 
 
446 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  33.75 
 
 
452 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  33.83 
 
 
422 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  36 
 
 
446 aa  186  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  36.45 
 
 
438 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  33.09 
 
 
470 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  34.58 
 
 
452 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  33.09 
 
 
470 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  32.85 
 
 
470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  34.77 
 
 
437 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  34.59 
 
 
451 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  35.17 
 
 
483 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  33.33 
 
 
433 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  33.59 
 
 
454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  33.64 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  33.71 
 
 
483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  30.75 
 
 
482 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  29.88 
 
 
474 aa  169  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  32.27 
 
 
472 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  35.65 
 
 
461 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  32.9 
 
 
506 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  31.89 
 
 
451 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  31.89 
 
 
451 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  31.89 
 
 
451 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  30.98 
 
 
502 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  33.75 
 
 
439 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  31.34 
 
 
461 aa  157  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  32.13 
 
 
487 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  31.4 
 
 
493 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  33.15 
 
 
454 aa  152  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  31.94 
 
 
473 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  31.5 
 
 
472 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  29.37 
 
 
495 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 
494 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.01 
 
 
489 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  29.45 
 
 
490 aa  138  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  34.89 
 
 
449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  30.38 
 
 
495 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 
486 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 
476 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 
495 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 
471 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 
485 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.94 
 
 
471 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.94 
 
 
471 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.94 
 
 
471 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.94 
 
 
471 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.94 
 
 
471 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  28.19 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 
549 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  28.26 
 
 
471 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.7 
 
 
471 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 
488 aa  132  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  29.16 
 
 
476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27.91 
 
 
500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 
438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 
466 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.23 
 
 
467 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  28.23 
 
 
471 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.23 
 
 
467 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 
466 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.75 
 
 
494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 
566 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 
468 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 
468 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 
501 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 
468 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 
549 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  28.86 
 
 
497 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.99 
 
 
467 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.99 
 
 
467 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.99 
 
 
467 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.01 
 
 
467 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 
466 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  28.85 
 
 
486 aa  124  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.99 
 
 
467 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  28.64 
 
 
468 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 
495 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  29.52 
 
 
478 aa  123  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  27.4 
 
 
542 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  27.59 
 
 
463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  27.85 
 
 
476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  27.85 
 
 
476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  29.09 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  29.09 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  27.07 
 
 
471 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>