255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2488 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  51.25 
 
 		 815 aa  823    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  46.83 
 
 		 809 aa  727    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  49.8 
 
 		 813 aa  815    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  44.73 
 
 		 796 aa  654    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  46.83 
 
 		 809 aa  727    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  49.8 
 
 		 813 aa  815    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  47.18 
 
 		 788 aa  699    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  100 
 
 		 925 aa  1915    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  49.08 
 
 		 799 aa  751    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  47.69 
 
 		 795 aa  749    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  46.45 
 
 		 784 aa  707    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  46.4 
 
 		 786 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  52.37 
 
 		 785 aa  839    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  48.02 
 
 		 796 aa  749    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  45.63 
 
 		 971 aa  730    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  46.18 
 
 		 768 aa  717    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  46.55 
 
 		 794 aa  710    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  40.45 
 
 		 778 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  39.26 
 
 		 998 aa  576  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  32.72 
 
 		 920 aa  416  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  31.97 
 
 		 455 aa  221  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  27.22 
 
 		 473 aa  154  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  43.05 
 
 		 154 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  25.05 
 
 		 479 aa  139  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  25.7 
 
 		 479 aa  137  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  25.7 
 
 		 479 aa  137  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  25.81 
 
 		 479 aa  137  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  52.14 
 
 		 195 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  25.81 
 
 		 463 aa  127  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  25.75 
 
 		 485 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  25.54 
 
 		 485 aa  125  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  53.41 
 
 		 279 aa  107  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  35.8 
 
 		 444 aa  99  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  27.31 
 
 		 654 aa  98.6  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  27.73 
 
 		 647 aa  94.4  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  32.84 
 
 		 443 aa  94.7  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  31.47 
 
 		 649 aa  93.2  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  26.17 
 
 		 650 aa  92.4  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  31.35 
 
 		 652 aa  90.5  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  33.33 
 
 		 451 aa  88.6  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  27.67 
 
 		 630 aa  88.2  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  35.1 
 
 		 488 aa  87  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  31.31 
 
 		 462 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  29.03 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  32.24 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  34.15 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  31.96 
 
 		 531 aa  83.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  27.5 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.07 
 
 		 558 aa  82.4  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  34.02 
 
 		 548 aa  82.8  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  34.1 
 
 		 499 aa  81.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  34.32 
 
 		 494 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  31.93 
 
 		 466 aa  80.5  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  35.81 
 
 		 509 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  35.81 
 
 		 509 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  34.07 
 
 		 558 aa  79.7  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  32.22 
 
 		 466 aa  80.1  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  30.86 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  29.59 
 
 		 590 aa  78.2  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  32.6 
 
 		 548 aa  77.4  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.58 
 
 		 550 aa  77.4  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  29.71 
 
 		 451 aa  77.4  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  23.63 
 
 		 773 aa  77  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  32.97 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  29.55 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.94 
 
 		 555 aa  74.3  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  33.54 
 
 		 479 aa  73.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  27.55 
 
 		 551 aa  73.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  30.95 
 
 		 456 aa  73.9  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  23.2 
 
 		 815 aa  73.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  30.41 
 
 		 549 aa  73.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  30.61 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  28.67 
 
 		 548 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  24.14 
 
 		 440 aa  72  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  28.98 
 
 		 550 aa  71.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  31.61 
 
 		 549 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  31.09 
 
 		 549 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  32.16 
 
 		 548 aa  70.1  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  24.22 
 
 		 1058 aa  69.7  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  24.4 
 
 		 531 aa  70.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  31.4 
 
 		 658 aa  69.3  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  24.04 
 
 		 812 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  29.61 
 
 		 551 aa  68.9  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  31.61 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  31.61 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  31.61 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  25.53 
 
 		 1061 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  32.06 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  30.77 
 
 		 556 aa  67  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  31.44 
 
 		 561 aa  67  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.09 
 
 		 548 aa  67  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  31.09 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  30.43 
 
 		 555 aa  66.6  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  32.61 
 
 		 554 aa  67  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  24.4 
 
 		 1055 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  31.69 
 
 		 557 aa  65.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  24.4 
 
 		 1055 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  26.55 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  21.3 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>