More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2062 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2072  proline/glycine betaine transporter-like protein  96.21 
 
 
422 aa  832    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2062  proline/glycine betaine transporter-like protein  100 
 
 
422 aa  854    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  33.42 
 
 
456 aa  236  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  32.29 
 
 
482 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  34.55 
 
 
444 aa  223  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  32.45 
 
 
485 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  32.45 
 
 
485 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  32.45 
 
 
485 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  32.45 
 
 
485 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  32.45 
 
 
485 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  32.45 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  32.2 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  32.2 
 
 
485 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  32.2 
 
 
485 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2045  major facilitator transporter  31.11 
 
 
445 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817358 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
435 aa  218  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  31.72 
 
 
483 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  32.18 
 
 
434 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
438 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
438 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1914  major facilitator transporter  33 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3727  major facilitator transporter  32.78 
 
 
467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0763  major facilitator transporter  32.81 
 
 
422 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000770218  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  31.63 
 
 
452 aa  213  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0013  putative permease  32.04 
 
 
446 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2411  major facilitator family transporter  32.51 
 
 
445 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.421854  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3284  major facilitator transporter  32.51 
 
 
445 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703744  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2314  hypothetical protein  30.64 
 
 
424 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2986  general substrate transporter  31.02 
 
 
449 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  31.91 
 
 
431 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  31.43 
 
 
444 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4433  amino acid MFS transporter  31.78 
 
 
450 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  31.43 
 
 
444 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  31.17 
 
 
444 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  29.53 
 
 
447 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  29.45 
 
 
449 aa  203  5e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  30.4 
 
 
444 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.41 
 
 
454 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3550  major facilitator transporter  34.88 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0636824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0952  General substrate transporter  32.06 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328435  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  31.54 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  29.86 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1677  major facilitator transporter  31.49 
 
 
445 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119827  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
426 aa  199  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0223  major facilitator family transporter  31.6 
 
 
464 aa  199  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  28.92 
 
 
443 aa  199  7e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  33.01 
 
 
454 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 
443 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3801  major facilitator family transporter  31.44 
 
 
445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  31.3 
 
 
436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  29.95 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  30.02 
 
 
438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  32.63 
 
 
433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  30.02 
 
 
438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  30.51 
 
 
425 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  30.86 
 
 
440 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  30.02 
 
 
438 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  31.54 
 
 
436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1369  major facilitator transporter  32.05 
 
 
446 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  28.92 
 
 
438 aa  196  6e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10171  putative proline/betaine transporter, MFS family protein  29.93 
 
 
420 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.643051 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  30.51 
 
 
425 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  30.51 
 
 
425 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  30.51 
 
 
425 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5260  major facilitator transporter  31.19 
 
 
448 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0336827  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  29.81 
 
 
438 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3438  major facilitator transporter  30.94 
 
 
448 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
443 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3987  general substrate transporter  29.36 
 
 
460 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3913  general substrate transporter  29.36 
 
 
460 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3928  general substrate transporter  29.36 
 
 
460 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721766  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  30.31 
 
 
458 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.29 
 
 
435 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  30.17 
 
 
425 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 
427 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0168  major facilitator family transporter  32.85 
 
 
415 aa  192  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0523  proline/betaine transport protein  33.41 
 
 
418 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1158  General substrate transporter  29.81 
 
 
436 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0069  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.11 
 
 
445 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.085509  hitchhiker  0.00969207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2178  General substrate transporter  29.66 
 
 
495 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  30.51 
 
 
425 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0499  proline/betaine transport protein  32.69 
 
 
418 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.05 
 
 
430 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  30.02 
 
 
500 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4580  major facilitator transporter  30.97 
 
 
434 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  30.02 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.02 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  30.02 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  30.27 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  30.02 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0610  major facilitator transporter  31.8 
 
 
466 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0130  general substrate transporter  30.81 
 
 
441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.471024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  30.02 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  31.96 
 
 
500 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  30.27 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0596  major facilitator transporter  31.8 
 
 
466 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1562  General substrate transporter  29.72 
 
 
472 aa  190  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2177  major facilitator transporter  29.98 
 
 
441 aa  190  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  31.07 
 
 
500 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0135583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>